کربن زدایی هیدروژن در واقع می تواند باعث آسیب به موتور شود، به خصوص برای وسایل نقلیه با مسافت پیموده شده زیاد یا آنهایی که قدیمی شده اند. اگر خودرو در حال حاضر در شرایط کمتر از بهینه باشد، کربن زدایی هیدروژن ممکن است به طور بالقوه به برخی از اجزای موتور یا مبدل کاتالیزوری آسیب برساند. بنابراین، آسیب به موتور ناشی از کربن زدایی هیدروژن واقعی است و تعویض قطعات آسیب دیده بعداً هزینه های اضافی را به همراه خواهد داشت و آن را به یک راه حل کم هزینه تبدیل می کند.
بسیاری از صاحبان خودرو در مورد لزوم کربن زدایی هیدروژن در فروشگاه های 4S جویا می شوند. در واقع، در درجه اول به وضعیت فعلی خودرو بستگی دارد. اگر خودرو مسافت پیموده شده کمی داشته باشد و نسبتاً جدید باشد، کربن زدایی هیدروژن ممکن است تا حدودی بر حذف رسوبات کربن خفیف از موتور تأثیر بگذارد. با این حال، افزودنی های سوخت می توانند به حذف کربن نیز دست یابند. از سوی دیگر، برای خودروهایی با مسافت پیموده شده بالا و طول عمر بیشتر، انتخاب کربن زدایی از هیدروژن توصیه نمی شود. بنابراین، ضرورت کربن زدایی هیدروژن به شرایط خاص بستگی دارد.
اصل پشت کربن زدایی هیدروژن شامل استفاده از یک ماشین تخصصی برای الکترولیز آب به اکسیژن و هیدروژن است. سپس هیدروژن به سیلندرهای موتور وارد می شود و از ارزش حرارتی بالا و نفوذپذیری بالای هیدروژن برای تمیز کردن رسوبات کربن داخل سیلندرها استفاده می کند.
